做合成的平時(shí)免不了會(huì)檢索一些文獻(xiàn),如何高效檢索對(duì)自己的有用信息就顯得尤為重要,如果進(jìn)實(shí)驗(yàn)室的話,往往是兩眼黑,不知道如何下手,要下手往往是漫天刷漿,抓不住重點(diǎn)!那么如何能抓住重點(diǎn),進(jìn)行有目的的去讀一些論文呢?今天為大家?guī)頇z索三大工具,希望對(duì)大家的工作有所幫助。
SciFinder Scholar
SciFinder Scholar是美國(guó)化學(xué)學(xué)會(huì)(ACS)旗下的化學(xué)文摘服務(wù)社CAS(Chemical Abstract Service)所出版的化學(xué)資料電子數(shù)據(jù)庫(kù)學(xué)術(shù)版。
應(yīng)用技巧:
1.SciFinder的一個(gè)小技巧,可能一開始我們使用SciFinder自帶的結(jié)構(gòu)式繪制工具,并不習(xí)慣。如果本來已經(jīng)有用Chemdraw畫好的結(jié)構(gòu)式,把它另存為mol格式,然后在SciFinder的檢索界面,點(diǎn)擊File-Open,打開它,即可把它調(diào)入SciFinder進(jìn)行檢索。
2.在SCIFINDER上,很多反應(yīng)直接檢索反應(yīng)式可能查不到,可以考慮將產(chǎn)品輸入后,挑選匹配度較大的化合物,進(jìn)行結(jié)構(gòu)檢索,會(huì)有意想不到的結(jié)果哦。另外,用PDF打印機(jī)將文章打印下來,再慢慢學(xué)習(xí)。里面的登陸號(hào)檢索也是很有用的。可以查一般中間體的性質(zhì)。
3.一般來說sicfinder我們常用的是structure search,可以進(jìn)行單個(gè)化合物的search,也可以進(jìn)行化學(xué)方程式search,可以進(jìn)行分子式的search,還有CAS number的search,和關(guān)鍵詞search。
4.structure search,主要問題是很多朋友把自己的最終想合成的結(jié)構(gòu)畫出來了,不管它有多么復(fù)雜。其實(shí)這個(gè)是錯(cuò)誤的,你想你合成的東西幾乎都是新的物質(zhì),scifinder那里能收錄啊,只要沒有人發(fā)表就沒有收錄。所以為了更準(zhǔn)確的找到你想要的相關(guān)的合成文獻(xiàn),建議你自己先減肥,把不必要的一些結(jié)構(gòu)給去掉,簡(jiǎn)化。
Beilstein
CrossFire Beilstein是世界上最大的關(guān)于有機(jī)化學(xué)事實(shí)的數(shù)據(jù)庫(kù),數(shù)據(jù)來源于175種期刊,已收錄9百多萬(wàn)個(gè)化合物和9百多萬(wàn)個(gè)反應(yīng)。作為最基本的化學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(kù),CrossFire Beilstein能幫助有機(jī)化學(xué)研究人員形成新思路、設(shè)計(jì)合成路徑(包括起始原料和中間體)、確定生物活性和物理性質(zhì)、了解外界環(huán)境對(duì)化合物的影響,等等。主要數(shù)據(jù)的索引分為3部分:化學(xué)物質(zhì)部分收集了結(jié)構(gòu)信息及相關(guān)的事實(shí)和參考文獻(xiàn),包括化學(xué)、物理和生物活性數(shù)據(jù);反應(yīng)部分提供化學(xué)物質(zhì)制備的詳細(xì)資料,幫助研究人員用反應(yīng)式檢索特定的反應(yīng)路徑;文獻(xiàn)部分包括引用、文獻(xiàn)標(biāo)題和文摘,化學(xué)物質(zhì)部分和反應(yīng)部分的條目與文獻(xiàn)部分有超鏈接。
CrossFire Beilstein數(shù)據(jù)庫(kù)是世界上最大的有機(jī)化學(xué)門戶還可以在桌面上直接訪問期刊上的文獻(xiàn)原文。數(shù)據(jù)來源為1779~1959年《BeilsteinHandbook》、《Beilstein有機(jī)化學(xué)大全》從正編到第2檢索方法四補(bǔ)編的全部?jī)?nèi)容和1960年以來的原始文獻(xiàn)(各種國(guó)CrossFireGmelin/Beilstein數(shù)據(jù)庫(kù))。
有3種基本檢索方式:關(guān)鍵詞檢索(TextSearch)、數(shù)據(jù)檢索(FactSearch)和結(jié)構(gòu)檢索(StructureSearch)。關(guān)鍵詞檢索方法相對(duì)簡(jiǎn)單。數(shù)據(jù)檢索也稱為快速檢索(EasyDataSearch),對(duì)于沒有結(jié)構(gòu)的物質(zhì)的查找十分有效。結(jié)構(gòu)檢索對(duì)化學(xué)工作者來說更加方便,也更直觀,只須通過一個(gè)畫圖軟件畫出化合物(或反應(yīng))的部分或精確結(jié)構(gòu)(可以添加各種結(jié)構(gòu)限制),就可以開始檢索了。在此基礎(chǔ)上,系統(tǒng)還提供了組合檢索和二次檢索兩種高級(jí)檢索方式。
Web of Science
個(gè)人覺得Web of science使用比較方便,不像beilstein有那么多的檢索方式,相對(duì)比較簡(jiǎn)單。我最常用的就是General Search,我覺得已經(jīng)足夠了。
檢索的一些技巧:
1)、物質(zhì)結(jié)構(gòu)、反應(yīng)方程式的檢索
① Beilstein的CrossFire完全匹配檢索較類似檢索的優(yōu)先等級(jí)高,按照優(yōu)先等級(jí)依次進(jìn)行檢索,ISI的Web of Science可以自己選擇采用完全匹配檢索還是基礎(chǔ)結(jié)構(gòu)檢索;
② 自己分析哪些部分是結(jié)構(gòu)中次要的基團(tuán),自己進(jìn)行替換。例如五元環(huán)用六元環(huán)代替,甲基用乙基代替等等;
③ 使用原子或者基團(tuán)的模糊表示方法:X表示鹵素原子,A表示非氫的原子,Q表示非碳且非氫的原子,M表示金屬原子,基團(tuán)的模糊化實(shí)例講解時(shí)再講。
2)、化合物名稱檢索:合成檢索中最廣泛使用的檢索方式,可以使用檢索語(yǔ)法。是提高檢索水平的重要入手點(diǎn)。所有檢索工具和數(shù)據(jù)庫(kù)都能使用。
① 化合物名稱不止一個(gè),可以按照出現(xiàn)頻率依次進(jìn)行嘗試;
例子:3-噻吩丙二酸就至少有一下兩個(gè)名稱:3-thiophenemalonic acid和3-thienylmalonic acid
② 要重視把化合物當(dāng)成其母體的衍生物,查找其母體的化合物名稱;
③ 要重視使用類型命名來進(jìn)行檢索;
例子:2-丁炔二酸的英文名為But-2-ynedioic acid,而所在類型名為alkyne carboxylic acid
3)、分子式檢索:最常用于CA on CD,需要配合化合物名稱共同使用。
4)、CAS號(hào)檢索:最常用于CA on CD,精確無比。可以先使用Beilstein的CrossFire查找到CAS號(hào)再進(jìn)行。
聲明:本文來源于網(wǎng)絡(luò),有機(jī)合成路線,來源鏈接:http://muchong.com/t-2111498-1;原作者不詳







